新冠研究致编辑信L1 | 来自正在发生的武汉疫情的新型冠状病毒的进化和对其刺突蛋白的建模分析

为了了解武汉冠状病毒的起源及其与其他冠状病毒的亲缘关系,我们对多种来源收集到的冠状病毒序列进行了系统进化分析。结果显示武汉冠状病毒在进化树上聚类在一起,并属于Beta冠状病毒属(图1A)。Beta冠状病毒是有衣壳包被的单链(正)链RNA病毒,能够感染野生动物,畜群和人,并导致偶然的爆发及通常没有明显症状的感染。

新英格兰医学杂志新冠编辑评论E02 | 一个新十年,一种新冠状病毒

人畜共患的冠状病毒第三次跨物种感染人类。这种病毒,暂时称为新型冠状病毒(2019-nCoV),首次在武汉市暴露于一个海鲜或生鲜市场的人身上发现。与其他两种致病性人类呼吸系统冠状病毒(严重急性呼吸系统综合征冠状病毒[SARS-CoV]和中东呼吸系统综合征冠状病毒[MERS-CoV])引起的疫情一样,新冠病毒引起的呼吸系统疾病通常很严重。

国际传染病杂志新冠编辑评论E01|新冠病毒引发对全球健康持续的疫情威胁——最近的中国武汉新型冠状病毒爆发

2019 年12月,中国湖北省武汉市爆发了一场原因不明的肺炎,其流行病学指证与华南海鲜批发市场有关,该市场内出售活体动物。中国卫生部门于 2019 年 12 月31 日通报世卫组织后,引起了广泛的关注,担心这可能标志着一项新型的严重的公众健康威胁(WHO, 2020a; Parr, 2020)。

新冠论文12 | 在中国发现的一种与人类呼吸系统疾病相关的新型冠状病毒

通过对支气管肺泡灌洗液样本进行宏基因组RNA测序,本文发现一种属于冠状病毒科的新型RNA病毒。通过对完整的病毒基因组(29,903碱基)进行系统发育分析显示,这种病毒和一群之前在中国从蝙蝠身上发现的类非典冠状病毒(属Betacoronavirus,亚属Sarbecovirus)最为相近(核苷酸相似性:89.1%)。此次新冠病毒的爆发表明来源于动物身上的病毒可以在人类身上导致严重疾病。

新冠论文11 | 一种新的可能来自蝙蝠的冠状病毒有关的肺炎爆发

本文报道了一种新型冠状病毒(2019-nCoV)的鉴定和特征,该病毒在中国武汉引起了急性呼吸综合征的流行。该疫情从2019年12月12日开始,截至2020年1月26日,已造成2050例实验室确诊感染和56例死亡病例。在疫情早期,从5名患者中获得了全长基因组序列。它们之间几乎完全相同,与SARS-冠状病毒有79.5%的序列相同。此外在全基因组水平,2019-nCoV与一种蝙蝠冠状病毒拥有96%的相同性。

新冠论文10 | 估算在2020年1月上半月中国未报道的新型冠状病毒病例:数据驱动模型分析早期暴发

2019年12月,一种新型冠状病毒( 2019-nCoV)引起的呼吸道疾病在中国武汉出现,并迅速蔓延到中国其他地区和一些其他国家。新型冠状病毒引起的病例在2020年1月1日至15日期间可能报道不足,因此我们估算了新冠病毒的未报告病例数和新冠病毒的基本复制数R0。

新冠论文09丨美国首例2019新型冠状病毒感染病例

本篇文章记录了病人从出现轻微症状(发热、干咳)到住院观察的整个过程。病人35岁,在1月15号从武汉返回到华盛顿,1月19号去医院诊断,将其隔离并将血液、鼻咽、口咽的样本送往美国疾控中心(CDC),1月20日确诊为2019新型冠状病毒。病人在住院后第六天出现呼吸困难的症状,第七天X光片的特征与由常见细菌引起的肺炎特征不同。第七天晚,医院决定使用一种正在开发的新药remdesivir,第八天症状得以减轻,并逐渐恢复至轻微症状(干咳)。