Alterations of the human gut microbiome in liver cirrhosis.
人们的肠道中存在着大量微生物，正常粪便中有超过三分之一的物质是这些微生物的菌体。肠道菌群中不同菌种所占的比重，以及每个菌种所处的不同生活状态，都可能反映乃至影响人体的健康状态。肝硬化作为备受重视的全球性疾病。肝脏通过肝门以及胆汁分泌系统与肠道相通。肝硬化会对肠道微生物造成什么影响，而肠道菌群的变化，又如何左右肝硬化的病情发展？一篇最新的《Nature》论文对此进行了深入研究。
Transcriptional and epigenetic dynamics during specification of human embryonic stem cells.
表观遗传调控是细胞核内染色体的高级组织形式，是目前干细胞研究领域的前沿和热点问题。包括胚胎干细胞和诱导干细胞在内的多功能干细胞都可以利用遗传学和表观遗传学的这种复杂网络，来维持自我更新和多向分化之间的精密平衡
Circular RNAs are a large class of animal RNAs with regulatory potency.
circular RNA是mRNA剪接的特殊产物，是一类具有潜在重要调控功能的RNA。但到目前为止，人体内究竟有多少种circular RNA，这些circular RNA究竟有什么生物学功能，还是一个有待研究的问题。最近，Nature杂志发表了一篇题为“Circular RNAs are a large class of animal RNAs with regulatory potency”的文章，对任何小鼠体内的circular RNA进行了系统鉴定，并对其可能的生物学功能进行了研究。
A promoter-level mammalian expression atlas.
哺乳动物个体包含至少400种细胞类型，这些细胞类型都具有一个相同的基因组，却具有独特的基因表达特征，从而具有不同的形态乃至生物学功能。不同细胞类型的特性是由转录调控决定的。目前为止我们还缺乏对生物体转录调控的全面的了解，直到最近 FANTOM 等几个团队联合发表了题为“A promoter-level mammalian expression atlas”的文章，通过CAGE-seq的方法对人和小鼠的转录起始位点（TSS）和启动子使用、转录因子调控进行了全面的描述。
Genomic-scale exchange of mRNA between a parasitic plant and its hosts.
科学家最近发现了一种潜在的新的植物沟通形式——寄生性植物菟丝子会与宿主植物交换大量的mRNA。
mRNA poly(A)长度不影响翻译效率
Subtelny等研究人员发表了题为“Poly(A)-tail profiling reveals an embryonic switch in translational control poly(A)”的文章，通过PAL-seq (poly(A)-tail profiling by sequencing) 技术研究了胚胎发育时期poly(A)尾巴长度与翻译效率的关系。相关成果公布在2014年1月29日Nature杂志上。
Formation, regulation and evolution of Caenorhabditis elegans 3'UTRs
mRNA的3’ UTR区是转录后调控的主要区域，虽然线虫的基因组已被解析，同时有大量的转录组数据支持，但截至到2011年大部分线虫mRNA的准确的polyA位点尚无准确注释。
MicroRNA-135b promotes cancer progression by acting as a downstream effector of oncogenic pathways in colon cancer.
近期科学家在结肠癌研究邻域以“MicroRNA-135b Promotes Cancer Progression by Acting as a Downstream Effector of Oncogenic Pathways in Colon Cancer”为题发表了miRNA在癌症研究邻域的新进展。研究者首先采用microRNA-seq分别在两种结肠癌小鼠动物模型中检测了miRNA的表达差异，在两种动物模型中都检出miRNA-135b过量表达，最后的RT-PCR及原位杂交验证实验都证实了该结果。为了进一步验证动物实验的结果，随后研究者在62份临床样本中检测了miR-135b的表达量，另外还下载了392名CRC患者的miRNA-seq数据分析其中miR-135b的表达情况，在同一名患者的癌组织和癌旁组织中也能检测出miR-135b的显著差异。
Relating the metatranscriptome and metagenome of the human gut.
最新关联宏基因组和宏转录组的一项研究 “Relating the metatranscriptome and metagenome of the human gut”，在线发表于2014年5月19日的《PNAS》杂志。这种技术是由美国Forsyth研究所、麻省综合医院和哈佛大学公共卫生学院等处的科学家开发的，该方法不需要专业人员和设施就可以收集用于基因组和转录组分析的唾液与粪便，同时还能保持样品的完整性；可减轻受试对象的一些负担，将使我们能够不受地理限制，开展纵向研究和大规模的收集研究这种方法也为消化道微生物组的基因组成和乳糜泻、口腔癌、牙周炎和肥胖症相关的细菌，提供了新的视角。
Targeted resequencing of the microRNAome and 3’UTRome reveals functional germline DNA variants with altered prevalence in epithelial ovarian cancer.
癌症的预测和早期诊断一直是医学界的难题，尽管已经有一些与癌症相关的基因异常得到鉴定，然而目前鉴定出来的与癌症相关的遗传性突变均定位于DNA的蛋白编码区，而且数目非常稀少。虽然全基因组范围内鉴定出了大量的非功能性突变，但是这些成果在医学诊断方面的用处并不大，其中一个可能的限制因素在于目前的研究主要局限于蛋白编码区的测序检测。