Chang团队的研究者们开发出了一种基于可逆补骨脂素交联（psoralen crosslinking）的方法PARIS，在活细胞中以近碱基对分辨率整体绘制RNA双联结构图谱。研究人员通过在三种人类和小鼠细胞类型中进行PARIS分析，描述了转录组内的常见远程结构、选择性构象及RNA-RNA反式相互作用。并通过对RNA结构进行进化分析，揭示了一些保守的RNA双联结构特征。
通过对300名肝癌病人的全基因组测序，鉴定了在肝癌中高频率发生突变的病毒整合位点、蛋白质编码位点、非编码位点和染色体结构变异位点，并研究了这些突变位点与已知致癌与抑癌基因的相互作用，为更好的肝癌预后提供依据。
1．通过共表达调控网络的构建，建立了脑组织基因表达的module；
2. 采用多套脑组织相关的数据，其数据类型包括芯片、转录组、GWAS、外显子组，通过多套数据的组合分析，鉴定了2类基因modules（共1298个基因）与脑部认知疾病关联；
3. 同时对这1298个基因在不同脑部组织及脑部不同发育时期的基因表达模式也进行了分析；
4. 为GWAS和外显子数据的整合分析提供了很好的思路；
1. LncRNA 长度大于200nt的非编码RNA，具有高度细胞特异性，新LncRNA有待发现及研究
2．二代测序技术给LncRNAs的鉴定与注释带来了极大的便利
3．研究表明LncRNA与疾病具有密切关系（细胞核及胞浆LncRNA具有不同的功能）
4．多种癌症的发生于特定的LncRNA密切相关（prostate cancers: the lncRNAs SChLAP1,PCAT-1, PCGEM1, and PRNCR1; breast cancers : BCAR4）
5．乳腺癌发生过程中LncRNA的分子机制暂不清楚
1. 原病毒(provirus)，是存在于宿主染色体内的，潜在的病毒染色体组，可以从一代宿主细胞转移到另一代细胞中而不使宿主破裂。
2．前人的研究显示provirus在胚胎干细胞中的表达是受到抑制的，但具体的机制尚不清楚。
3．siRNA screen ，RNA-seq、chip-seq等成熟技术为系统性鉴定细胞调控因子提供了方便。
1. LncRNA 长度大于200nt的非编码RNA，Long intergenic noncoding RNAs (lincRNAs)是其中的一种。
2．二代测序技术给LncRNAs的鉴定与注释带来了极大的便利。
3．研究表明在人类的转录组中存在10000多种lincRNAs，其中2/3起源于转座子。
4．HPATs 属于lincRNAs，总共有23个成员，在胚囊的发育中有较高的表达量，但它们的功能的和作用机制都不清楚。
1. 肺腺癌是最常见的NSCLC组织学类型。
2．肺癌的发生、发展过程受遗传和环境两方面的共同影响。其中，基因变异是产生疾病的内因和基础。
3．尚无有针对性对亚洲患者肺腺癌的大规模测序研究，缺少亚洲人原发性和转移肿瘤的综合突变全景图。
通过对比检测TPD-43敲除的小鼠ES细胞和人类HeLa细胞的选择性剪切情况，发现受到TPD-43抑制调控的隐秘外显子（Cryptic exons）剪切在ALS发生中起重要作用。研究者们鉴定出的数个受TPD-43调控剪切的隐秘外显子已在FTD-ALS病例中得到证实。
研究者们对283名健康和患癌对象身上提取血小板RNA进行测序，分析血小板RNA在各种癌症患者和健康个体中的分布情况，并评估肿瘤血小板（Tumor-educated platelets, TEPs）RNA profile能否成为癌症辅助诊断和分级的方法。
