新冠论文12 | 在中国发现的一种与人类呼吸系统疾病相关的新型冠状病毒
通过对支气管肺泡灌洗液样本进行宏基因组RNA测序，本文发现一种属于冠状病毒科的新型RNA病毒。通过对完整的病毒基因组（29,903碱基）进行系统发育分析显示，这种病毒和一群之前在中国从蝙蝠身上发现的类非典冠状病毒(属Betacoronavirus,亚属Sarbecovirus)最为相近(核苷酸相似性：89.1%)。此次新冠病毒的爆发表明来源于动物身上的病毒可以在人类身上导致严重疾病。
新冠论文11 | 一种新的可能来自蝙蝠的冠状病毒有关的肺炎爆发
本文报道了一种新型冠状病毒(2019-nCoV)的鉴定和特征，该病毒在中国武汉引起了急性呼吸综合征的流行。该疫情从2019年12月12日开始，截至2020年1月26日，已造成2050例实验室确诊感染和56例死亡病例。在疫情早期，从5名患者中获得了全长基因组序列。它们之间几乎完全相同，与SARS-冠状病毒有79.5%的序列相同。此外在全基因组水平，2019-nCoV与一种蝙蝠冠状病毒拥有96%的相同性。
新冠论文10 | 估算在2020年1月上半月中国未报道的新型冠状病毒病例：数据驱动模型分析早期暴发
2019年12月，一种新型冠状病毒（ 2019-nCoV）引起的呼吸道疾病在中国武汉出现，并迅速蔓延到中国其他地区和一些其他国家。新型冠状病毒引起的病例在2020年1月1日至15日期间可能报道不足，因此我们估算了新冠病毒的未报告病例数和新冠病毒的基本复制数R0。
新冠论文09丨美国首例2019新型冠状病毒感染病例
本篇文章记录了病人从出现轻微症状（发热、干咳）到住院观察的整个过程。病人35岁，在1月15号从武汉返回到华盛顿，1月19号去医院诊断，将其隔离并将血液、鼻咽、口咽的样本送往美国疾控中心（CDC），1月20日确诊为2019新型冠状病毒。病人在住院后第六天出现呼吸困难的症状，第七天X光片的特征与由常见细菌引起的肺炎特征不同。第七天晚，医院决定使用一种正在开发的新药remdesivir，第八天症状得以减轻，并逐渐恢复至轻微症状（干咳）。
新冠论文08 | 预测预报源于中国武汉新冠病毒爆发潜在的国内外传播：一个模型研究
自2019年12月31日以来，中国武汉市报告了由新型冠状病毒（2019-nCoV）引起的非典型肺炎疫情。病例已扩散到中国其他城市以及国际上，有可能引发全球疫情。在这里，我们根据武汉向中国大陆以外城市输出的病例数量，对武汉的疫情规模进行了估计，并预测了国内和全球流行病的公共卫生风险程度，同时考虑了社会和非药物预防干预措施。
新冠论文07 | 2019年新型冠状病毒大幅“第一代”人传人的可能性
为了研究中国和泰国新冠病毒（2019-nCov）爆发的遗传多样性、时间起源和进化史，本文分析了12个已经公布的病毒基因组序。这12个病毒均有已知的采样日期（2019年12月24日及2020年1月13日）和采样地点（主要是中国湖北省武汉市，也有泰国曼谷)。本研究对这些基因组序列进行了系统发育和似然映射分析。
基于我们的研究结果，新冠病毒的星型信号和拓扑结构可能暗示着潜在大规模的“第一代”人传人病毒传播。
新冠论文06 | 99例2019中国武汉新型冠状病毒肺炎病例的流行病学和临床特征：一项描述性研究
在这项回顾性、单中心的研究中，我们纳入了2020年1月1日至1月20日在武汉金银潭医院确诊的所有新冠病毒的病例。结论显示，新冠病毒感染为群体性起病，更容易感染患有合并症的老年男性，可导致严重甚至致命的呼吸系统疾病，如急性呼吸窘迫综合征。总的来说，死亡患者的特征符合MuLBSTA评分，该评分是预测病毒性肺炎死亡的早期预警模型。MuLBSTA评分在预测新冠病毒感染死亡风险中的适用性需要进一步研究。
新冠论文05 | 新型冠状病毒感染肺炎在中国武汉的早期传播动态
新型冠状病毒（新冠病毒）感染的肺炎（NCIP）的最初病例于2019年12月和2020年1月发生在中国湖北省武汉市。我们分析了武汉市前425例确诊病例的数据，以确定新型冠状病毒肺炎的流行病学特征。结论显示，有证据表明自2019年12月中以来在亲密接触者之间已发生人与人之间的传播。如果类似的动态在其他地方也适用，则将需要采取大量努力来减少传播以控制暴发。预防或减少传播的措施应在高危人群中实施。
新冠论文04 | 2019新型冠状病毒流行病：病毒进化的证据
一种被命名为2019-nCoV的新型冠状病毒正成为全球性的公共健康威胁并引起关注。在本文中，我们对这种新病毒提供了一个初步的进化和分子流行病学分析。用能够获得的15个新冠病毒全基因组序列和来自gene bank的12个序列高度相似的冠状病毒全基因组序列（5个来自SARS冠状病毒，2个来自中东呼吸综合症冠状病毒，5个来自蝙蝠SARS样冠状病毒）我们建立了一个进化树。FUBAR分析显示，核衣壳和刺突蛋白有一些位点处于正向选择压力下，而同源建模帮助解释了病毒间的一些分子和结构差异。进化树显示新冠病毒显著的与2015年分离的蝙蝠SARS样冠状病毒聚类在一起，而结构分析显示S和核衣壳蛋白发生了突变。根据这些结果，新冠病毒可以被认为是一种区别于SARS病毒的冠状病毒，可能通过在蝙蝠或其他宿主上的突变获得感染人类的能力并传播给人类。
新冠论文03 | 2019年一种来自中国肺炎患者的新型冠状病毒
2019年12月，一群不明原因的肺炎患者被发现与中国武汉一家海鲜批发市场有关。通过对肺炎患者的样本进行严格测序，发现了一种新型的β冠状病毒——2019-nCoV（分离自人的气道上皮细胞）。2019-nCoV是感染人类的第七种冠状病毒，不同于之前的MERS-CoV和SARS-CoV。正在进行加强检测和进一步调查。