新英格兰医学杂志新冠编辑评论E02 | 一个新十年,一种新冠状病毒
人畜共患的冠状病毒第三次跨物种感染人类。这种病毒,暂时称为新型冠状病毒(2019-nCoV),首次在武汉市暴露于一个海鲜或生鲜市场的人身上发现。与其他两种致病性人类呼吸系统冠状病毒(严重急性呼吸系统综合征冠状病毒[SARS-CoV]和中东呼吸系统综合征冠状病毒[MERS-CoV])引起的疫情一样,新冠病毒引起的呼吸系统疾病通常很严重。
人畜共患的冠状病毒第三次跨物种感染人类。这种病毒,暂时称为新型冠状病毒(2019-nCoV),首次在武汉市暴露于一个海鲜或生鲜市场的人身上发现。与其他两种致病性人类呼吸系统冠状病毒(严重急性呼吸系统综合征冠状病毒[SARS-CoV]和中东呼吸系统综合征冠状病毒[MERS-CoV])引起的疫情一样,新冠病毒引起的呼吸系统疾病通常很严重。
2019 年12月,中国湖北省武汉市爆发了一场原因不明的肺炎,其流行病学指证与华南海鲜批发市场有关,该市场内出售活体动物。中国卫生部门于 2019 年 12 月31 日通报世卫组织后,引起了广泛的关注,担心这可能标志着一项新型的严重的公众健康威胁(WHO, 2020a; Parr, 2020)。
一种新型冠状病毒(2019 nCoV)的爆发正在出现,这种病毒可以引起严重的呼吸系统疾病,如SARS和MERS,人与人之间的传播已经被证实。这些特点正推动着中国紧急的公共卫生行动,以及国际社会的关注。但仍有许多未知。有关新冠病毒拼图的碎片才刚刚开始整合在一起。
我们的研究结果表明,瑞德西韦和氯喹在体外对新冠病毒感染有很好的控制作用。由于这些化合物已经在有安全记录的人类患者中被使用,并且证明对不同疾病有效,我们建议这些药物可以在患有新型冠状病毒病的人类患者进行评估。
通过对支气管肺泡灌洗液样本进行宏基因组RNA测序,本文发现一种属于冠状病毒科的新型RNA病毒。通过对完整的病毒基因组(29,903碱基)进行系统发育分析显示,这种病毒和一群之前在中国从蝙蝠身上发现的类非典冠状病毒(属Betacoronavirus,亚属Sarbecovirus)最为相近(核苷酸相似性:89.1%)。此次新冠病毒的爆发表明来源于动物身上的病毒可以在人类身上导致严重疾病。
本文报道了一种新型冠状病毒(2019-nCoV)的鉴定和特征,该病毒在中国武汉引起了急性呼吸综合征的流行。该疫情从2019年12月12日开始,截至2020年1月26日,已造成2050例实验室确诊感染和56例死亡病例。在疫情早期,从5名患者中获得了全长基因组序列。它们之间几乎完全相同,与SARS-冠状病毒有79.5%的序列相同。此外在全基因组水平,2019-nCoV与一种蝙蝠冠状病毒拥有96%的相同性。
2019年12月,一种新型冠状病毒( 2019-nCoV)引起的呼吸道疾病在中国武汉出现,并迅速蔓延到中国其他地区和一些其他国家。新型冠状病毒引起的病例在2020年1月1日至15日期间可能报道不足,因此我们估算了新冠病毒的未报告病例数和新冠病毒的基本复制数R0。
本篇文章记录了病人从出现轻微症状(发热、干咳)到住院观察的整个过程。病人35岁,在1月15号从武汉返回到华盛顿,1月19号去医院诊断,将其隔离并将血液、鼻咽、口咽的样本送往美国疾控中心(CDC),1月20日确诊为2019新型冠状病毒。病人在住院后第六天出现呼吸困难的症状,第七天X光片的特征与由常见细菌引起的肺炎特征不同。第七天晚,医院决定使用一种正在开发的新药remdesivir,第八天症状得以减轻,并逐渐恢复至轻微症状(干咳)。
自2019年12月31日以来,中国武汉市报告了由新型冠状病毒(2019-nCoV)引起的非典型肺炎疫情。病例已扩散到中国其他城市以及国际上,有可能引发全球疫情。在这里,我们根据武汉向中国大陆以外城市输出的病例数量,对武汉的疫情规模进行了估计,并预测了国内和全球流行病的公共卫生风险程度,同时考虑了社会和非药物预防干预措施。
为了研究中国和泰国新冠病毒(2019-nCov)爆发的遗传多样性、时间起源和进化史,本文分析了12个已经公布的病毒基因组序。这12个病毒均有已知的采样日期(2019年12月24日及2020年1月13日)和采样地点(主要是中国湖北省武汉市,也有泰国曼谷)。本研究对这些基因组序列进行了系统发育和似然映射分析。
基于我们的研究结果,新冠病毒的星型信号和拓扑结构可能暗示着潜在大规模的“第一代”人传人病毒传播。