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5月302016

Mitochondrial iron chelation ameliorates cigarette smoke–induced bronchitis and emphysema in mice

CNS-Readingablife2016年5月30日

慢性阻塞性肺部疾病(Chronic obstructive pulmonary disease, COPD)是一种复杂,削弱肺部功能的疾病,主要临床和病理表现包括从气道炎症(慢性支气管炎),肺组织破坏(肺气肿)小气道重塑等(1,2)。COPD的发病机制至今仍然不明确,但是它涉及到肺部对香烟烟雾(cigarette smoke, CS)的异常炎症和细胞反应失调(1)。目前研究表明吸烟和遗传是COPD最大的危险因素(3)。本文作者之前通过对人类全基因组进行全基因组关联分析(genome-wide association studies, GWAS)确定IRP2(也称为IREB2)是COPD的主要候选基因(4-6),此后作者证明IRP2蛋白在COPD患者的肺部含量增加(4)。已有的研究表明IRP2基因位于人类15q25染色体上,该染色体上还包括编码烟碱乙酰胆碱受体的几个部件的基因。此外 GWAS分析表明15q25还与肺癌,外周动脉疾病和尼古丁成瘾相关(7-10)。铁调节蛋白(The iron-regulatory proteins, IRPs)IRP1和IRP2尤其是IRP2负责调节哺乳动物体内细胞铁离子的平衡(11)。IRPs在十二指肠,脊髓和中枢神经扮演非常重要的生理角色,同时IRPs也可能是肺动脉高压和神经性病变等疾病发病原因(12-15)。在细胞内铁耗尽的情况下,IRPs通过与位于mRNA上铁体内平衡基因的铁反应元件(iron-response elements, IREs)结合,导致其翻译被抑制从而降低铁的储存并同时增加铁摄取(12,15)。但是IRP2在肺部的生理功能以及IRP2的mRNA转录还不是很清楚,同时IRP2在肺部暴露在香烟烟雾中COPD发病的响应机制也不是很明确。因此,作者试图通过将COPD实验中小鼠模型和人COPD数据整合,阐述由香烟烟雾引起的COPD中IRP2的功能。

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5月32016

Whole-genome mutational landscape and characterization of noncoding and structural mutations in liver cancer

CNS-Readingablife2016年5月3日

通过对300名肝癌病人的全基因组测序,鉴定了在肝癌中高频率发生突变的病毒整合位点、蛋白质编码位点、非编码位点和染色体结构变异位点,并研究了这些突变位点与已知致癌与抑癌基因的相互作用,为更好的肝癌预后提供依据。

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5月32016

Systems genetics identifies a convergent gene network for cognition and neurodevelopmental disease

CNS-Readingablife2016年5月3日

1.通过共表达调控网络的构建,建立了脑组织基因表达的module;
2. 采用多套脑组织相关的数据,其数据类型包括芯片、转录组、GWAS、外显子组,通过多套数据的组合分析,鉴定了2类基因modules(共1298个基因)与脑部认知疾病关联;
3. 同时对这1298个基因在不同脑部组织及脑部不同发育时期的基因表达模式也进行了分析;
4. 为GWAS和外显子数据的整合分析提供了很好的思路;

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5月32016

PRC2 Is Required to Maintain Expression of the Maternal Gtl2-Rian-Mirg Locus by Preventing De Novo DNA Methylation in Mouse Embryonic Stem Cells

CNS-Readingablife2016年5月3日
3月72016

Discovery, Annotation, and Functional Analysis of Long Noncoding RNAs Controlling Cell-Cycle Gene Expression and Proliferation in Breast Cancer Cells

CNS-Readingablife2016年3月7日

1. LncRNA 长度大于200nt的非编码RNA,具有高度细胞特异性,新LncRNA有待发现及研究
2.二代测序技术给LncRNAs的鉴定与注释带来了极大的便利
3.研究表明LncRNA与疾病具有密切关系(细胞核及胞浆LncRNA具有不同的功能)
4.多种癌症的发生于特定的LncRNA密切相关(prostate cancers: the lncRNAs SChLAP1,PCAT-1, PCGEM1, and PRNCR1; breast cancers : BCAR4)
5.乳腺癌发生过程中LncRNA的分子机制暂不清楚

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12月212015

Systematic identification of factors for provirus silencing in embryonic stem cells

CNS-Readingablife2015年12月21日

1. 原病毒(provirus),是存在于宿主染色体内的,潜在的病毒染色体组,可以从一代宿主细胞转移到另一代细胞中而不使宿主破裂。
2.前人的研究显示provirus在胚胎干细胞中的表达是受到抑制的,但具体的机制尚不清楚。
3.siRNA screen ,RNA-seq、chip-seq等成熟技术为系统性鉴定细胞调控因子提供了方便。

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12月212015

The primate-specific noncoding RNA HPAT5 regulates pluripotency during human preimplantation development and nuclear reprogramming

CNS-Readingablife2015年12月21日

1. LncRNA 长度大于200nt的非编码RNA,Long intergenic noncoding RNAs (lincRNAs)是其中的一种。
2.二代测序技术给LncRNAs的鉴定与注释带来了极大的便利。
3.研究表明在人类的转录组中存在10000多种lincRNAs,其中2/3起源于转座子。
4.HPATs 属于lincRNAs,总共有23个成员,在胚囊的发育中有较高的表达量,但它们的功能的和作用机制都不清楚。

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12月212015

Frequent alteration in cytoskeleton remodelling genes in primary and metastatic lung adenocarcinomas

CNS-Readingablife2015年12月21日

1. 肺腺癌是最常见的NSCLC组织学类型。
2.肺癌的发生、发展过程受遗传和环境两方面的共同影响。其中,基因变异是产生疾病的内因和基础。
3.尚无有针对性对亚洲患者肺腺癌的大规模测序研究,缺少亚洲人原发性和转移肿瘤的综合突变全景图。

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12月212015

TDP-43 repression of nonconserved cryptic exons is compromised in ALS-FTD

CNS-Readingablife2015年12月21日

通过对比检测TPD-43敲除的小鼠ES细胞和人类HeLa细胞的选择性剪切情况,发现受到TPD-43抑制调控的隐秘外显子(Cryptic exons)剪切在ALS发生中起重要作用。研究者们鉴定出的数个受TPD-43调控剪切的隐秘外显子已在FTD-ALS病例中得到证实。

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12月212015

RNA-Seq of Tumor-Educated Platelets Enables Blood-Based Pan-Cancer, Multiclass, and Molecular Pathway Cancer Diagnostics

CNS-Readingablife2015年12月21日

研究者们对283名健康和患癌对象身上提取血小板RNA进行测序,分析血小板RNA在各种癌症患者和健康个体中的分布情况,并评估肿瘤血小板(Tumor-educated platelets, TEPs)RNA profile能否成为癌症辅助诊断和分级的方法。

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关于生命之美

武汉生命之美科技有限公司成立于2010年7月,是一家专注于将高通量测序技术(NGS)转化为科学发现和产业应用的生物高科技企业。生命之美使用新一代测序技术和RNA-蛋白质互作的科学技术优势,短短数年时间,就成长为一个拥有强大实验室和科研实力的合作平台。生命之美不但已经与各高校、研究所的实验室一起合作science,也启动了与普通大众一起science的模式,希望以健康产品服务每一名个体。生命之美为爱和梦想而来,它期待着与中国、一带一路各国乃至全球的伙伴们一起做一个前所未有的科学梦:用科学祝福全球!

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公司动态
  • 热烈祝贺生命之美CEO张翼博士荣获省级荣誉
    2020年10月26日
  • 生命之美与华农赵凌课题组合作文章发表于Genome Biology
    2020年9月17日
  • 生命之美与上交大团队合作文章发表于PLoS Pathogens
    2020年9月17日
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