Inner workings of thrombolites: spatial gradients of metabolic activity as revealed by metatranscriptome profiling.
微生物岩是由微生物及其环境的代谢相互作用形成的沉积物。这些岩化微生物群落代表着地球上最古老的生态系统之一,但这些微生物群落功能的分子机制知之甚少。
微生物岩是由微生物及其环境的代谢相互作用形成的沉积物。这些岩化微生物群落代表着地球上最古老的生态系统之一,但这些微生物群落功能的分子机制知之甚少。
不同类群的海洋浮游植物进行着全球一半的初级生产。浮游植物巨大的多样性长期以来困扰着生态学家,因为这些微生物共存于一个同质的环境,同时争夺相同的基本资源(如无机养分)。资源的差异化生态位分离是一种假说来解释这种”悖论的浮游生物”,但很难原位量化和跟踪浮游植物的代谢变化。
最新关联宏基因组和宏转录组的一项研究 “Relating the metatranscriptome and metagenome of the human gut”,在线发表于2014年5月19日的《PNAS》杂志。这种技术是由美国Forsyth研究所、麻省综合医院和哈佛大学公共卫生学院等处的科学家开发的,该方法不需要专业人员和设施就可以收集用于基因组和转录组分析的唾液与粪便,同时还能保持样品的完整性;可减轻受试对象的一些负担,将使我们能够不受地理限制,开展纵向研究和大规模的收集研究这种方法也为消化道微生物组的基因组成和乳糜泻、口腔癌、牙周炎和肥胖症相关的细菌,提供了新的视角。