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Genomic-scale exchange of mRNA between a parasitic plant and its hosts.

1.文章简介

文章题目 Genomic-scale exchange of mRNA between a parasitic plant and its hosts
中文题目
期刊名 Science IF:34.661
作者
发表时间 2014
实验材料
测序平台
相关产品 RNA-seq

科学家最近发现了一种潜在的新的植物沟通形式——寄生性植物菟丝子会与宿主植物交换大量的mRNA。

菟丝子能利用其特殊器官吸根从宿主中获取水与养分。吸根会穿透宿主组织并建立联系,这些联系能让该寄生植物不仅能从其宿主那里吸入水与营养物质,而且还能吸取mRNA和蛋白质这样的大分子,甚至病菌。细胞间的mRNA传递调节着植物的发育过程,如叶子形状和开花时间等。

Kim等应用转录组测序技术(RNA-seq,技术路线见图1),分析了菟丝子与其两种宿主拟南芥和番茄之间的mRNA传递情况。当拟南芥被菟丝子寄生时,能在菟丝子中检测到拟南芥45%(9518)的转录组;然而,从菟丝子中转移到拟南芥的mRNA数量较少(8655)。mRNA的转移率在番茄—菟丝子之间较低 (表1)。菟丝子吸根选择性的机制可能是宿主特异性的。进一步分析表明,这些可移动的mRNA比普通的mRNA有更高的丰度(FPKM比较)。另外,mRNA的传递与基因的功能相关联,例如,其中很大一部分移动的mRNA与植物响应外界刺激有关。

研究人员将会对这些可移动的mRNA意义做进一步的阐明。为何不同品种植物之间存在如此大规模的mRNA转移,可移动的mRNA是否会翻译成蛋白或通过其他机制起作用,菟丝子能否区别自身和来自宿主的转录产物等都是非常有趣的问题。
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原文出处:

Kim G, LeBlanc ML, Wafula EK, dePamphilis CW, Westwood JH (2014) Genomic-scale exchange of mRNA between a parasitic plant and its hosts. Science 345: 808-811.

菊子曰 菊子曰:推广必备的博客营销软件
Category: CNS-Reading2014年9月2日
标签: RNA-seq
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