The dynamic N1-methyladenosine methylome in eukaryotic messenger RNA
近些年研究表明N6-methyladenosine (m6A) 在mRNA代谢中扮演重要角色，此外，pseudouridine (Ψ)和 5-methylcytosine 也被发现在基因表达的转录后修饰中启着重要作用。N1-methyladenosine在信使RNA中的修饰则未见报道。
简介
DNA甲基化是一种在DNA核苷酸胞嘧啶(C)或腺嘌呤(A)上加上甲基的生化过程。DNA甲基化可以在细胞从胚胎干细胞分裂和分化成特定组织的过程中稳定地改变细胞中基因的表达。这一过程通常是永久和单向的，从而阻止细胞退分化为干细胞或者变成其他种类的细胞。DNA甲基化同时也是染色质结构形成的基础，在几乎所有种类的癌症发展中都扮演者非常重要的角色。
亚硫酸盐测序(Bisulfite sequencing，简称为BS-seq)是一种利用亚硫酸盐处理DNA来测定其甲基化模式的方法(Chatterjee et al., 2012)。DNA甲基化是最初被发现的表观遗传标记，直到现在仍是研究最多的表观遗传标记。在动物中，DNA甲基化主要包括CpG岛的胞嘧啶(C)的C-5位置的甲基化，然后导致转录活性的抑制。
其原理在于，亚硫酸盐可使DNA上的胞嘧啶(C)转变成为尿嘧啶(U)，同时已受甲基化的5-甲基胞嘧啶则不受影响。如此一来，通过亚硫酸盐处理可以使实验 者得知DNA序列上的特定改变从而确定其甲基化的情形。许多类似分析可以通过修改序列来获得这类信息，这类分析的目标在于区分由亚硫酸盐处理导致的单核苷 酸多态性（胞嘧啶和胸腺嘧啶）。
亚硫酸测序的优点使其能够应用于基因组尺度的分析，然而在此之前，总体测量DNA甲基化仅能通过其他技术手段实现，如限制性标记基因组扫描。在人类基因组计划完成后，许多科学家随后绘制出了人类表观组图谱(Bradbury, 2003; Esteller, 2006)。这一表观遗传信息的获得将对遗传序列执行和调控功能的理解十分重要。表观组比基因组相对不稳定，因此表观组被认为在基因-环境互作中起重要作用(Jones and Martienssen, 2005)
