1.文章简介
| 文章题目 | DNA demethylation dynamics in human prenatal germline cells |
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| 期刊名 | |
| 作者 | |
| 发表时间 | 2015 |
| 实验材料 | |
| 测序平台 | |
| 相关产品 | BS-seq |
精子和卵子的融合是动物胚胎发育的起点，不过这一过程并不仅仅是简单的融合。哺乳动物细胞的甲基化模式是在发育中逐渐形成的，在胚胎发育初期，全基因组的甲基化模式会发生明显变化。比如说小鼠胚胎受精之前，雌雄生殖细胞具有较高的甲基化水平，胚胎着床前发生大规模的DNA去甲基化。为了了解人类生殖细胞的去甲基化和甲基化的重编程程度，加州大学和台湾中央研究院的科学家们对发育53天至137天的人类胚胎生殖细胞进行了研究。研究人员通过全基因组重亚硫酸盐测序（WGBS）和RNA测序（RNA-seq）获得单碱基分辨率的人生殖细胞甲基化组。分析结果表明，人生殖细胞的转录组和甲基化组不同于多能干细胞（PSC）和囊胚内细胞团（ICM）。参照以上组学研究结果，研究人员还对初始状态的多能干细胞（primed PSC）退回原始基态（naïve ground state）时的DNA去甲基化进行了全基因组的观察了解，研究发现这一去甲基化过程存在一些热点区域（超低甲基化的转座子区），这些转座子区在生殖细胞和内细胞团中是免于去甲基化的。这一研究成果有利于我们利用人类生殖细胞来研究人类细胞在全基因组去甲基化后表观遗传调控模式的形成过程。
原文出处：
Shain A H, Garrido M, Button T, et al. Exome sequencing of desmoplastic melanoma identifies recurrent NFKBIE promoter mutations and diverse activating mutations in the MAPK pathway[J]. <em>Nature Genetics</em>, 2015.
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