1.文章简介
| 文章题目 | Poly(A)-tail profiling reveals an embryonic switch in translational control |
| 中文题目 | |
| 期刊名 | Nature IF:38.138 |
| 作者 | |
| 发表时间 | 2014 |
| 实验材料 | |
| 测序平台 | |
| 相关产品 | Poly(A)-seq |
Subtelny等研究人员发表了题为“Poly(A)-tail profiling reveals an embryonic switch in translational control poly(A)”的文章，通过PAL-seq (poly(A)-tail profiling by sequencing) 技术研究了胚胎发育时期poly(A)尾巴长度与翻译效率的关系。相关成果公布在2014年1月29日Nature杂志上。
在此之前，科学家们已认为poly(A) 尾巴长度能够影响 mRNA的翻译效率，即poly(A)尾巴越长，蛋白翻译效率越高效。例如，在爪蟾和果蝇的胚胎中，人为延长mRNA的poly(A)尾巴长度均能提高翻译效率。另外，除酵母之外，尾巴长度和翻译效率的系统性研究还没有报道，主要是因为缺乏对更长长度的poly(A)尾巴的高通量测量技术。
本文中，研究人员通过PAL-seq技术对酵母、植物、脊椎动物和哺乳动物细胞的数百万RNA进行了测序，并发现poly(A)尾巴长度在不同物种中具有多样性，甚至相同基因的mRNA的poly(A)尾巴长度也有变化。同时，他们应用核糖体印记分析和RNA-seq技术分析了这些mRNA的翻译效率。研究发现，在早期的斑马鱼和青蛙胚胎中，poly(A)尾巴长度和翻译效率表现出期待中的耦合在一起的关系，但这种强烈的耦合关系在胚胎原肠胚形成阶段减弱，且在非胚胎样本中消失。
microRNA(miRNAs)与靶标mRNA上具体位置互补配对，抑制mRNA的转录后翻译。本文作者研究了早期斑马鱼胚胎一直到原肠胚形成阶段期间的miRNA 功能。在原肠胚形成阶段之前的胚胎中，miRNA通过切除它们的靶 mRNA上的poly(A) 尾巴而降低这些 mRNA 的翻译效率，然而在原肠胚形成阶段之后，miRNA 主要是让它们的靶标 mRNA 降解。
Subtelny表示：“我们的研究结果可能让人们重新思考与大多数细胞中 poly(A)尾巴相关的基因调节机制，我们认为包括神经细胞和卵母细胞在内的一些细胞可能具有与我们在早期胚胎中观察到的相类似的基因调节。”
原文出处：
Subtelny AO, Eichhorn SW, Chen GR, Sive H, Bartel DP (2014) Poly(A)-tail profiling reveals an embryonic switch in translational control. Nature 508: 66-71.
