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RBP沉默RNA-seq数据包

利用转录组测序技术(RNA-seq),从整体水平研究RBP沉默后对基因表达模式、表达水平以及可变剪接事件的影响,提供全面的转录组信息。

RBP在HeLa细胞系中的shRNA沉默效率,提供qRT-PCR结果。RBP沉默对HeLa细胞增殖、侵袭转移及细胞凋亡的影响。

对样品原始转录组RNA-seq进行基础分析,包括测序质量评估、有效reads提取、reads比对、测序饱和度统计、碱基含量统计、基因的表达统计,基因组各区域分布统计,mRNA上Reads覆盖一致性分析,样品相关性统计等。

对RNA-seq数据进行高级分析,包括差异表达基因分析、可变剪接分析、差异可变剪接分析,差异可变剪接和差异基因的关联分析、功能聚类分析等。

设置2组生物学重复及相应对照,提供原始RNA-seq数据。

赠送人类RBP的shRNA质粒:提供shRNA靶标序列。包含U6 polymerase III启动子,用于哺乳动物细胞中的shRNA表达。包含卡那霉素(Kanamycin)和杀稻瘟菌素(Blasticidin)抗性,方便在转化或转染的细胞中进行筛选。包含MMLV LTR序列,可用于慢病毒载体包装。具有pCMV-GFP表达,用于检测转染效率。适用于多种哺乳动物细胞系的瞬时或稳定转染。

关于生命之美

武汉生命之美科技有限公司成立于2010年7月,是一家专注于将高通量测序技术(NGS)转化为科学发现和产业应用的生物高科技企业。生命之美使用新一代测序技术和RNA-蛋白质互作的科学技术优势,短短数年时间,就成长为一个拥有强大实验室和科研实力的合作平台。生命之美不但已经与各高校、研究所的实验室一起合作science,也启动了与普通大众一起science的模式,希望以健康产品服务每一名个体。生命之美为爱和梦想而来,它期待着与中国、一带一路各国乃至全球的伙伴们一起做一个前所未有的科学梦:用科学祝福全球!

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公司动态
  • 热烈祝贺生命之美CEO张翼博士荣获省级荣誉
    2020年10月26日
  • 生命之美与华农赵凌课题组合作文章发表于Genome Biology
    2020年9月17日
  • 生命之美与上交大团队合作文章发表于PLoS Pathogens
    2020年9月17日
主要业务
  • 科技服务
  • RBP产品
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