Discovery, Annotation, and Functional Analysis of Long Noncoding RNAs Controlling Cell-Cycle Gene Expression and Proliferation in Breast Cancer Cells

1. LncRNA 长度大于200nt的非编码RNA,具有高度细胞特异性,新LncRNA有待发现及研究
2.二代测序技术给LncRNAs的鉴定与注释带来了极大的便利
3.研究表明LncRNA与疾病具有密切关系(细胞核及胞浆LncRNA具有不同的功能)
4.多种癌症的发生于特定的LncRNA密切相关(prostate cancers: the lncRNAs SChLAP1,PCAT-1, PCGEM1, and PRNCR1; breast cancers : BCAR4)
5.乳腺癌发生过程中LncRNA的分子机制暂不清楚

美国whitehead生物医学研究所季雄博士来生命之美访问交流

2016年1月11日,美国Whitehead生物医学研究所季雄博士后来我公司访问交流。季雄博士2013年毕业于武汉大学,曾在公司首席科学家张翼博士与付向东教授联合培养实验室攻读博士学位,在研期间以第一作者发表Cell及Molecular Cell研究论文各一篇。季博士现就职于美国Whitehead生物医学研究所Richard A Young课题组,主要从事组蛋白修饰以及DNA调控元件在胚胎干细胞调节通路中的作用机制。此次交流季博士做了题为“The 3D Regulatory Landscape of Human Genome”的报告,这一成果发表在Cell Stem Cell杂志上。

Systematic identification of factors for provirus silencing in embryonic stem cells

1. 原病毒(provirus),是存在于宿主染色体内的,潜在的病毒染色体组,可以从一代宿主细胞转移到另一代细胞中而不使宿主破裂。
2.前人的研究显示provirus在胚胎干细胞中的表达是受到抑制的,但具体的机制尚不清楚。
3.siRNA screen ,RNA-seq、chip-seq等成熟技术为系统性鉴定细胞调控因子提供了方便。

The primate-specific noncoding RNA HPAT5 regulates pluripotency during human preimplantation development and nuclear reprogramming

1. LncRNA 长度大于200nt的非编码RNA,Long intergenic noncoding RNAs (lincRNAs)是其中的一种。
2.二代测序技术给LncRNAs的鉴定与注释带来了极大的便利。
3.研究表明在人类的转录组中存在10000多种lincRNAs,其中2/3起源于转座子。
4.HPATs 属于lincRNAs,总共有23个成员,在胚囊的发育中有较高的表达量,但它们的功能的和作用机制都不清楚。

SRSF1-Regulated Alternative Splicing in Breast Cancer

1. 可变剪接在基因表达过程中起着关键作用,最近研究表明,癌基因及肿瘤抑制因子剪接调控的紊乱与恶性肿瘤的形成关系密切。
2.SRSF1是一个典型的剪接相关蛋白,该基因被发现在人乳腺癌中呈现过度表达。同时,过表达SFSR1能够促进乳腺细胞的转化,而这一进程可能与其剪接因子的功能特性相关。
3.目前对于SRSF1对RNA的结合特性以及其调控规律还不太清楚。
4.一些研究报道表明,在果蝇和小鼠中SRSF1能够调控一系列基因的选择性剪接,但是这种剪接作用与人类疾病的相关性仍不明确。