2016年1月11日，美国Whitehead生物医学研究所季雄博士后来我公司访问交流。季雄博士2013年毕业于武汉大学，曾在公司首席科学家张翼博士与付向东教授联合培养实验室攻读博士学位，在研期间以第一作者发表Cell及Molecular Cell研究论文各一篇。季博士现就职于美国Whitehead生物医学研究所Richard A Young课题组，主要从事组蛋白修饰以及DNA调控元件在胚胎干细胞调节通路中的作用机制。此次交流季博士做了题为“The 3D Regulatory Landscape of Human Genome”的报告，这一成果发表在Cell Stem Cell杂志上。

该项工作采用cohesin ChIA-PET、CHIP-seq、Hi-C技术构建了一种3D DNA环图谱（如下图），该DNA环主要包括Active enhancers，Enhancer-Promoter以及CTCF-CTCF/Cohesin loop。研究者发现这种CTCF-CTCF loop的结合位点在灵长类动物中高度的保守，且多关联一些低甲基化的区域。这些环帮助建立了一个隔绝的区域，限制了DNA调控元件对互作基因的调控作用。进一步的研究显示当细胞在癌变条件下，CTCF的结合位点常常发生改变。该工作帮助我们更好的理解基因突变与疾病发生发展之间的关系，未来研究者们希望通过该技术及时发现基因的异常调节。

原文链接：http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1934590915005056

季雄博士简介：

教育经历：

  • 2004-2008  武汉大学 学士
  • 2008-2013  武汉大学 博士
  • 2009-2012  美国UC,San Diego，交流学习

主要科研工作经历

  • 2013-至今 美国Whitehead生物医药研究所 博士后

获奖情况

  • 2013年  吴瑞奖学金
  • 2014年  湖北省优秀博士学位论文奖

主要发表论文

  1. Ji, X., Dadon, D.B., Powell, B.E., Zi, P.F., Borges-Rivera, D., Shachar, S., Weintraub, A., Hnisz, D., Pegoraro, G., Lee, T.I., Misteli, T., Jaenisch, R., and Young, R.A. 3D chromosome regulatory landscape of human pluripotent cells. Cell Stem Cell, in press
  2. Ji, X., Dadon, D.B., Abraham, B.J., Lee, T.I., Jaenisch, R., Bradner, J.E., and Young, R.A. (2015). Chromatin proteomic profiling reveals novel proteins associated with histone-marked genomic regions. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 112, 3841-3846.
  3. Ji, X., Zhou, Y., Pandit, S., Huang, J., Li, H., Lin, C.Y., Xiao, R., Burge, C.B., and Fu, X.D. (2013). SR proteins collaborate with 7SK and promoter-associated nascent RNA to release paused polymerase. Cell 153, 855-868.
  4. Ji, X., and Fu, X.D. (2012). The mediator couples transcription and splicing. Molecular Cell 45, 433-434.
Category: 公司动态