1.文章简介
文章题目 | Determination and Inference of Eukaryotic Transcription Factor Sequence Specificity |
中文题目 | |
期刊名 | |
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发表时间 | 2014 |
实验材料 | |
测序平台 | |
相关产品 | CHIP-seq |
TFs(transcription factor DNA sequence)是与转录因子结合的DNA片断,长度通常在5~20 bp范围内。转录因子与DNA序列的结合具有序列偏好性,这种偏好性能指导转录因子的调控行为。但目前所研究的TFs尚不足全部数目的1%。
多伦多大学等研究机构的科研工作者运用CHIP-seq 测序技术对131 个真核生物的TFs展开了分析,共发现170000多个TFs, 从而建立了一个适用的TFs文库,综合分析TFs文库数据还发现,亲缘关系较近的物种具有类似的TFs 偏好性。TFs文库有可能帮忙我们鉴定出致病等位基因的特异TFs,从而对人类健康诊断有积极意义。
原文出处:
Weirauch MT, Yang A, Albu M, Cote AG et al., 2014. Determination and inference of eukaryotic transcription factor sequence specificity. Cell, 158(6):1431-1443.
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