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Determination and Inference of Eukaryotic Transcription Factor Sequence Specificity

1.文章简介

文章题目 Determination and Inference of Eukaryotic Transcription Factor Sequence Specificity
中文题目
期刊名
作者
发表时间 2014
实验材料
测序平台
相关产品 CHIP-seq

TFs(transcription factor DNA sequence)是与转录因子结合的DNA片断,长度通常在5~20 bp范围内。转录因子与DNA序列的结合具有序列偏好性,这种偏好性能指导转录因子的调控行为。但目前所研究的TFs尚不足全部数目的1%。
多伦多大学等研究机构的科研工作者运用CHIP-seq 测序技术对131 个真核生物的TFs展开了分析,共发现170000多个TFs, 从而建立了一个适用的TFs文库,综合分析TFs文库数据还发现,亲缘关系较近的物种具有类似的TFs 偏好性。TFs文库有可能帮忙我们鉴定出致病等位基因的特异TFs,从而对人类健康诊断有积极意义。
http://114.115.208.242/wp-content/uploads/2015/11/ChIP-seq.png

原文出处:

Weirauch MT, Yang A, Albu M, Cote AG et al., 2014. Determination and inference of eukaryotic transcription factor sequence specificity. Cell, 158(6):1431-1443.
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菊子曰 菊子曰:最好用的长微博工具!
Category: CNS-Reading2015年11月25日
标签: ChIP-seq
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武汉生命之美科技有限公司成立于2010年7月,是一家专注于将高通量测序技术(NGS)转化为科学发现和产业应用的生物高科技企业。生命之美使用新一代测序技术和RNA-蛋白质互作的科学技术优势,短短数年时间,就成长为一个拥有强大实验室和科研实力的合作平台。生命之美不但已经与各高校、研究所的实验室一起合作science,也启动了与普通大众一起science的模式,希望以健康产品服务每一名个体。生命之美为爱和梦想而来,它期待着与中国、一带一路各国乃至全球的伙伴们一起做一个前所未有的科学梦:用科学祝福全球!

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