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Neural circular RNAs are derived from synaptic genes and regulated by development and plasticity.

1.文章简介

文章题目 Neural circular RNAs are derived from synaptic genes and regulated by development and plasticity.
中文题目
期刊名
作者
发表时间 2015
实验材料
测序平台
相关产品 Circular-RNA

来自德国马克斯-德尔布吕克分子医学研究中心的Schuman和陈炜的研究团队,对小鼠的不同组织进行RNA深度测序,发现circRNA在小鼠大脑中高度表达而且有很大一部分来自编码突触蛋白的基因。研究显示,许多circRNA的丰度在突触形成时突然改变,说明circRNA可能在发育过程中调控突触的功能。

研究人员比较了rRNA剔除的RNA-seq和polyA富集的RNA-seq后发现,polyA富集的RNA-seq中鉴别到的circRNA远少于rRNA剔除的RNA-seq;同时还发现circRNA具有RNase R核酸外切酶耐受性,并从中筛选12个circRNA进行PacBio深度测序,这一测序技术可从circRNA生成滚环cDNA,能够揭示单核苷酸分辨率的环状结构。
http://114.115.208.242/wp-content/uploads/2015/11/circRNA_Neural.png

上图为circRNA的分析流程简图,下左为PacBio深度测序简图,下右为rRNA剔除RNA-seq和polyA富集 RNA-seq的circRNA丰度图。

原文出处:

Xintian Y, Irena V, Ana B, et al. Neural circular RNAs are derived from synaptic genes and regulated by development and plasticity.[J]. Nature Neuroscience, 2015, 18(4):603-610.

 

菊子曰 菊子曰:我在用着的博客编辑软件
Category: CNS-Reading2015年11月13日
标签: Circular-RNA
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武汉生命之美科技有限公司成立于2010年7月,是一家专注于将高通量测序技术(NGS)转化为科学发现和产业应用的生物高科技企业。生命之美使用新一代测序技术和RNA-蛋白质互作的科学技术优势,短短数年时间,就成长为一个拥有强大实验室和科研实力的合作平台。生命之美不但已经与各高校、研究所的实验室一起合作science,也启动了与普通大众一起science的模式,希望以健康产品服务每一名个体。生命之美为爱和梦想而来,它期待着与中国、一带一路各国乃至全球的伙伴们一起做一个前所未有的科学梦:用科学祝福全球!

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