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N6-methyladenosine marks primary microRNAs for processing miRNA甲基化的新功能

1.文章简介

文章题目 N6-methyladenosine marks primary microRNAs for processing miRNA甲基化的新功能
中文题目
期刊名
作者
发表时间 2014
实验材料
测序平台
相关产品 CAGE-seq

据今年三月的Nature杂志报道,洛克菲勒大学的Sohail F. Tavazoie团队发现m6A(N6-methyladenosine)是促进microRNA生成的关键性转录后修饰。初级microRNA(pri-miRNA)需要经过一系列的加工才能形成成熟的miRNA,这其中的第一步是由DGCR8识别pri-miRNA茎环结构,再招募DROSHA切割双链RNA,生成前体miRNA(pre-miRNA)。在此之前,DGCR8如何在众多转录本二级结构中识别并结合pri-miRNA的结构并不清楚。
Tarazoie团队使用FIRE算法(Finding Informative Regulatory Elements)找到了基因组中包含有miRNA里区域里越权出现(overpresented)的序列,并鉴定为已有过报道的m6A甲基化酶METTL3的识别序列GGAC。使用shRNA在细胞系中敲低METTL3后,成熟miRNA在细胞中全面减少,而未成熟的pri-miRNA在细胞中积累。该团队使用m6A-seq和METTL3 HITS-CLIP技术,比对了富集的m6A甲基化pri-miRNA和与METTL3交联的RNA序列,发现两者中GGAC序列均被大量富集。这些证据都强烈暗示METTL3介导的m6A甲基化是pri-miRNA识别加工的重要步骤。
该团队接下来进行了体外实验以验证METTL3介导的m6A甲基化在pri-miRNA识别加工中的作用。他们使用过表达DGCR8和DROSHA的HEK239T细胞提取物对体外表达的m6A甲基化pri-miRNA和未甲基化pri-miRNA进行处理,发现m6A甲基化pri-miRNA的加工成熟效率明显提高。体内实验也证实DGCR8可与m6A甲基化pri-miRNA结合,而METTL3介导的m6A甲基化在帮助pri-miRNA被DGCR8特异识别方面起重要作用。这种甲基化修饰不存在细胞特异性,能全面促进各类miRNA的成熟。因为miRNA在某些癌症中异常表达,检测METTL3表达量的变化可能作为某些癌症筛查的分子标记。
http://114.115.208.242/wp-content/uploads/2015/11/CAGE_N6-1024x904.png
原文出处:
Alarcón C R, Hyeseung L, Hani G, et al. N6-methyladenosine marks primary microRNAs for processing.[J]. Nature, 2015, 519(7544):482-5.

 

菊子曰 菊子曰:专业的博客营销工具
Category: CNS-Reading2015年11月13日
标签: CAGE-seq
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武汉生命之美科技有限公司成立于2010年7月,是一家专注于将高通量测序技术(NGS)转化为科学发现和产业应用的生物高科技企业。生命之美使用新一代测序技术和RNA-蛋白质互作的科学技术优势,短短数年时间,就成长为一个拥有强大实验室和科研实力的合作平台。生命之美不但已经与各高校、研究所的实验室一起合作science,也启动了与普通大众一起science的模式,希望以健康产品服务每一名个体。生命之美为爱和梦想而来,它期待着与中国、一带一路各国乃至全球的伙伴们一起做一个前所未有的科学梦:用科学祝福全球!

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