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单细胞测序(scRNA-seq)

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  • 文章导读

技术简介

1. 技术简介

单细胞技术是指在单个细胞水平上,对基因组、转录组、表观组和蛋白组等进行文库构建和高通量测序分析的新技术,它能够揭示单个细胞的基因结构和基因表达状态,反映细胞间的异质性,2013年被Nature Method评选为年度技术。单细胞技术可同时平行分析成千上万个单细胞内数千个基因的表达变化,正在改变我们对细胞类型和功能的理解,将进一步助力在免疫学、神经生物学、胚胎发育和肿瘤及微环境等多个领域内生物学过程的探索和研究。

2015年以来,随着BD Rhapsody™、10X Genomics、Drop-seq、Micro-well、Split-seq等单细胞测序技术的飞速发展,单细胞测序的成本大幅度降低,大规模样本的单细胞测序已成为可能。

2. 技术方法:

  • 单细胞转录组测序:

是在单细胞水平对转录组进行扩增与测序的一项新技术。其原理是将分离的单个细胞的微量转录组RNA进行扩增后进行高通量测序。

  • 单细胞ATAC测序:

染色质分为常染色质和异染色质,而常染色质处于松散的开放状态,允许反式作用结合顺式调控元件,进而调控基因表达。ATAC-seq利用tn5酶切割并捕获染色质开放区域,结合高通量测序和生信分析,可以系统研究全基因组范围内染色质开放区域,是表观调控的新方向。

  • 单细胞免疫组库测序:

以T/B淋巴细胞为研究目标,通过多重PCR或5’RACE技术特异性扩增决定B淋巴细胞受体(BCR)或T淋巴细胞受体(TCR)多样性的互补决定区(CDR3区),再结合高通量测序技术,全面评估免疫系统的多样性,深入挖掘免疫组库与疾病的关系。通过单细胞测序平台进行免疫组库研究,可同时实现单细胞转录组和单细胞V(D)J测序,为免疫组学研究提供更具扩展性的平台。

服务内容

1.实验流程

 

2.分析流程

3.服务优势

  • 方案设计:根据老师研究方向,协助调研通过单细胞测序技术能解决的科学问题,根据科学问题,结合样本类型,预期细胞总量及经费预算,进行实验设计确定实验分组与样本数。
  • 价格优势:基于BD和10X单细胞建库平台,支持混样建库,降低科研项目单细胞转录组测序费用。
  • 单细胞悬液样品制备:根据客户的样本特点,通过查阅文献和进行样品处理预实验,制定样品特异的单细胞悬浮液制备方案,协助支持客户完成单细胞悬浮液样品制备。
  • 图表支持和数据解读:提供标准化的数据分析报告和发表级别的图表,并对数据进行简单明了的解读。
  • 个性化数据分析和亮点挖掘。

文章导读

Sustained IFN-I stimulation impairs MAIT cell responses to bacteria by inducing IL-10 during chronic HIV-1 infection

Sustained IFN-I stimulation impairs MAIT cell responses to bacteria by inducing IL-10 during chronic HIV-1 infection

2020年10月27日

该文章基于单细胞技术解析了HIV感染者和健康对照外周血T细胞转录组图谱,发现HIV感染者外周血MAIT细胞共刺激分子和干扰素诱导基因显著上调。

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关于生命之美

武汉生命之美科技有限公司成立于2010年7月,是一家专注于将高通量测序技术(NGS)转化为科学发现和产业应用的生物高科技企业。生命之美使用新一代测序技术和RNA-蛋白质互作的科学技术优势,短短数年时间,就成长为一个拥有强大实验室和科研实力的合作平台。生命之美不但已经与各高校、研究所的实验室一起合作science,也启动了与普通大众一起science的模式,希望以健康产品服务每一名个体。生命之美为爱和梦想而来,它期待着与中国、一带一路各国乃至全球的伙伴们一起做一个前所未有的科学梦:用科学祝福全球!

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公司动态
  • 热烈祝贺生命之美CEO张翼博士荣获省级荣誉
    2020年10月26日
  • 生命之美与华农赵凌课题组合作文章发表于Genome Biology
    2020年9月17日
  • 生命之美与上交大团队合作文章发表于PLoS Pathogens
    2020年9月17日
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