MicroRNA directly enhances mitochondrial translation during muscle differentiation.

7月31日,国际著名期刊Cell报道了关于肌肉细胞分化过程中miRNA对线粒体中蛋白翻译系统调控的最新研究成果,我公司首席科学家张翼博士参与了该项目的指导研究。

MicroRNA (miRNA)是一类长度约为22个核苷酸的非编码单链RNA分子,通常情况下,它能与胞质中的mRNA的特定位点结合,导致mRNA的降解或抑制蛋白质的合成,但在特定细胞环境中,如血浆饥饿细胞,miRNA也能促进基因转录与表达。

miRNA对线粒体中蛋白翻译系统调控的新模式

7月31日,国际著名期刊Cell报道了关于肌肉细胞分化过程中miRNA对线粒体中蛋白翻译系统调控的最新研究成果,我公司首席科学家张翼博士参与了该项目的指导研究。
MicroRNAs (miRNAs)是一类长度约为22个核苷酸的非编码单链RNA分子,通常情况下,它能与胞质中的mRNA的特定位点结合,导致mRNA的降解或抑制蛋白质的合成。这篇文章中,研究人员发现在小鼠C2C12细胞的胞质和线粒体基质中同时存在miR-1,它会结合到不同的靶基因上,参与到不同调控机制中。
在胞质中,miR-1与Ago2和GW182家族蛋白组成的RNA沉默复合体,抑制靶基因转录。但是,当肌细胞处于生长或分化等特殊时期,需要额外的能量供给,胞质中的miR-1就会同Ago2蛋白一起,进入到线粒体基质中,但GW182家族蛋白则无法一同进入,且由于线粒体DNA所转录的mRNA没有5’ 帽子结构,在线粒体内miR-1-Ago2复合体不再是抑制基因转录,它会结合到ND1、COX1等基因的mRNA上,增强它们的翻译能力,进一步促进氧化磷酸化,从而提供更多的能量。

N6-methyladenosine-dependent regulation of messenger RNA stability.

腺苷酸N6位甲基化是高等真核生物最普遍的RNA修饰,虽然该修饰被发现与细胞的形态和发育相关,但其具体的调控方式却一直未被报道。2014年1月,Wang等人在Nature杂志上以letter的形式,首次报道了m6A调控基因表达的方式。该研究发现
m6A修饰的RNA可以被YTHDF2蛋白特异识别,被该蛋白结合会导致mRNA转运到p-body,从而导致mRNA的降解。因此m6A修饰可以调控mRNA的翻译和稳定性,在该修饰被发现近40年后,首次从机制上揭示了其调控方式。

Alterations of the human gut microbiome in liver cirrhosis.

人们的肠道中存在着大量微生物,正常粪便中有超过三分之一的物质是这些微生物的菌体。肠道菌群中不同菌种所占的比重,以及每个菌种所处的不同生活状态,都可能反映乃至影响人体的健康状态。肝硬化作为备受重视的全球性疾病。肝脏通过肝门以及胆汁分泌系统与肠道相通。肝硬化会对肠道微生物造成什么影响,而肠道菌群的变化,又如何左右肝硬化的病情发展?一篇最新的《Nature》论文对此进行了深入研究。

Circular RNAs are a large class of animal RNAs with regulatory potency.

circular RNA是mRNA剪接的特殊产物,是一类具有潜在重要调控功能的RNA。但到目前为止,人体内究竟有多少种circular RNA,这些circular RNA究竟有什么生物学功能,还是一个有待研究的问题。最近,Nature杂志发表了一篇题为“Circular RNAs are a large class of animal RNAs with regulatory potency”的文章,对任何小鼠体内的circular RNA进行了系统鉴定,并对其可能的生物学功能进行了研究。

A promoter-level mammalian expression atlas.

哺乳动物个体包含至少400种细胞类型,这些细胞类型都具有一个相同的基因组,却具有独特的基因表达特征,从而具有不同的形态乃至生物学功能。不同细胞类型的特性是由转录调控决定的。目前为止我们还缺乏对生物体转录调控的全面的了解,直到最近 FANTOM 等几个团队联合发表了题为“A promoter-level mammalian expression atlas”的文章,通过CAGE-seq的方法对人和小鼠的转录起始位点(TSS)和启动子使用、转录因子调控进行了全面的描述。

mRNA poly(A)长度不影响翻译效率

Subtelny等研究人员发表了题为“Poly(A)-tail profiling reveals an embryonic switch in translational control poly(A)”的文章,通过PAL-seq (poly(A)-tail profiling by sequencing) 技术研究了胚胎发育时期poly(A)尾巴长度与翻译效率的关系。相关成果公布在2014年1月29日Nature杂志上。