热烈祝贺我公司和客户合作研究在Genome Research 上发表文章
Liu, S. et al. Annotation and cluster analysis of spatiotemporal- and sex-related lncRNA expression in Rhesus macaque brain. Genome Res, doi:10.1101/gr.217463.116 (2017).
热烈祝贺中国科学院昆明动物研究所 李家立课题组使用我公司的RNA-seq和CAGE-seq技术和高通量测序平台在Genome Research上发表题为“Annotation and cluster analysis of spatiotemporal- and sex-related lncRNA expression in Rhesus macaque brain”的文章，揭示了长链非编码RNAs在灵长类大脑发育和老化过程中表达动态变化和作用。该项目得到中科院百人计划、科技部 “973”项目、国家自然科学基金以及科学院B类先导专项等基金项目的支持。昆明动物所灵长类中心为该研究提供了重要的资源和技术支持。我公司在技术上，以及后期的科学发现上起到了重要的推动作用。该文共同第一作者为昆明动物所博士生刘斯灵、助理研究员王正波和田仁荣，我公司的陈栋主任和中国科大生命科学学院博士生张博文，通讯作者为昆明动物所李家立研究员、我公司的CEO兼首席科学家 张翼博士和中国科大教授汪香婷教授。
Genome Research的影响因子为11.922，为生物学大类1区杂志。
在本项研究中，李家立学科组及其合作者利用中国猕猴作为对象，通过RNA-seq和 CAGE-seq深度测序及分析，同时结合原位杂交与原代神经元系统的功能验证等一系列实验方法和手段，成功地解析了在中国猕猴大脑发育和老化过程中的动态变化特征。研究发现，大脑特异性lncRNAs呈现出高度的区域、性别和年龄表达差异性；依据这些表达差异性，总共发现18个不同的 lncRNAs和14个不同的mRNAs表达模块式。相对于mRNAs的表达变化特征，猕猴脑特异性lncRNAs的表达性状在发育和老化过程中呈现出更高的动态变化特征。在此基础上，利用CAGE-seq对lncRNA和mRNA启动子区域进行测序和分析，发现lncRNAs的启动子区域变化比mRNA呈现出更明显的性别差异和时空变化性状。进一步研究还发现，lncRNAs和 mRNAs之间存在多重的正相关和负相关调控关系，其中在大脑皮层区域特异性表达的lncRNAs和 mRNAs之间负相关的调控关系对发育和老化过程中大脑皮层的结构和神经元功能变化具有重要的调控作用。上述研究结果为进一步认识和理解灵长类动物复杂的大脑结构和高级认知功能的表观调控基础提供了新的实验依据，也为进一步探索与脑发育、和衰老相关的神经系统疾病的发病机理和治疗新靶点提供了新的研究方向。
原文链接：Annotation and cluster analysis of spatiotemporal- and sex-related lncRNA expression in Rhesus macaque brain