棉花真菌中的可变剪接调控
—–记公司与合作伙伴联合发表论文

可变剪接事件在高等动物中起着非常重要的调控功能,使得生物能利用较少的编码基因产生多样的转录本,进而翻译成多种蛋白质,但是这种调控是否也在真菌中发挥作用不得而知。生命之美合作伙伴-湖北省农科院喻大昭、万鹏课题组首次在一种真菌中研究了可变剪接的作用机制。研究成果“Transcriptome analysis reveals the complexity of alternative splicing regulation in the fungus Verticillium dahliae ”发表在BMC Genomics杂志上。该工作得到了国家科技支撑计划(项目编号2012BAD19B05)以及生命之美创新基金(项目编号201206003)的支持。
研究人员对强致病毒力以及对照菌株进行了转录组测序,通过分析发现在真菌外显子基因上超过一半以上的基因都存在可变剪接事件。且真菌中的可变剪接调控远比我们设想的更复杂,例如其中一个基因甚至能通过不同的5'splice 位点以及3'splice 位点的组合产生至少5种成熟的mRNA(如图)。这些可变剪接事件所在的基因涉及些重要的生理功能,例如ATP合成、真菌的繁殖、胚胎发生以及信号转导等。这项研究对于研究病原真菌中的致病机制有着指导意义。
黄萎病基因VDAG_01312中的可变剪接事件可视化图及验证结果图

原文链接:Transcriptome analysis reveals the complexity of alternative splicing regulation in the fungus Verticillium dahliae