1.文章简介
| 文章题目 | Integrative genome-wide analysis reveals HLP1, a novel RNA-binding protein, regulates plant flowering by targeting alternative polyadenylation |
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| 期刊名 | |
| 作者 | |
| 发表时间 | 2015 |
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ABLife直接参与了本研究
可变聚腺苷酸化(APA)是一种普遍的基因调控机制并与开花相牵连，但植物从营养生长到生殖生长转换期间调整选择特定poly(A)位点的分子基础仍不清楚。
HLP1 regulates flowering.
HLP1 preferentially binds to the A- and U-rich elements in the 3′-UTR and introns of targeted transcripts
文章中作者描述了HLP1（一种核不均一核糖核蛋白A/B蛋白质）作为一种新型的在拟南芥mRNA前体的3’端加工的调节器。遗传分析表明，HLP1抑制开花位点C（FLC，拟南芥开花的一个关键阻遏）。HLP1-RNA相互作用的全基因组映射表明HLP1优先结合围绕切割和多聚腺苷酸化位点的A丰富和U丰富元件，暗示其在3’端形成中的作用。作者发现HLP1是在参与RNA代谢和开花的转录本中显著富集。综合分析poly(A)位点的使用情况发现HLP1突变导致数以千计的poly(A)位点的变化。一个远侧至近侧的poly(A)位点转变发生在开花调节基因FCA（HLP1的直接靶标）中，导致FLC表达的上调和花期推迟。
Enriched HLP1 binding to floral genes.
作者的研究结果阐明HLP1是参与3’端加工一个新的因子，并通过调节APA来控制繁殖时机。
原文出处：
Zhang, Y., Gu, L., Hou, Y., Wang, L., Deng, X., Hang, R., Chen, D., Zhang, X., Zhang, Y., and Liu, C., et al. (2015). Integrative genome-wide analysis reveals HLP1, a novel RNA-binding protein, regulates plant flowering by targeting alternative polyadenylation. CELL RES 25, 864-876.
