1.文章简介
| 文章题目 | Neural circular RNAs are derived from synaptic genes and regulated by development and plasticity. |
| 中文题目 | |
| 期刊名 | |
| 作者 | |
| 发表时间 | 2015 |
| 实验材料 | |
| 测序平台 | |
| 相关产品 | Circular-RNA |
来自德国马克斯-德尔布吕克分子医学研究中心的Schuman和陈炜的研究团队，对小鼠的不同组织进行RNA深度测序，发现circRNA在小鼠大脑中高度表达而且有很大一部分来自编码突触蛋白的基因。研究显示，许多circRNA的丰度在突触形成时突然改变，说明circRNA可能在发育过程中调控突触的功能。
研究人员比较了rRNA剔除的RNA-seq和polyA富集的RNA-seq后发现，polyA富集的RNA-seq中鉴别到的circRNA远少于rRNA剔除的RNA-seq；同时还发现circRNA具有RNase R核酸外切酶耐受性，并从中筛选12个circRNA进行PacBio深度测序，这一测序技术可从circRNA生成滚环cDNA，能够揭示单核苷酸分辨率的环状结构。
上图为circRNA的分析流程简图，下左为PacBio深度测序简图，下右为rRNA剔除RNA-seq和polyA富集 RNA-seq的circRNA丰度图。
原文出处：
Xintian Y, Irena V, Ana B, et al. Neural circular RNAs are derived from synaptic genes and regulated by development and plasticity.[J]. Nature Neuroscience, 2015, 18(4):603-610.
