DNA Methylation on N6-Adenine in C. elegans.

1.文章简介

在哺乳动物中，发生在胞嘧啶第5位碳原子上的DNA甲基化（5mC），是非常重要的表观遗传标记，而线虫中由于检测不到5mC 和胞嘧啶DNA甲基转移酶同源物而被认为缺乏DNA的甲基化。但是来自哈佛医学院的Eric Greer教授和施扬教授的研究发现，利用MeDIP-Seq和SMRT-seq相结合，检测到线虫的DNA中存在甲基化的腺嘌呤（6mA），而且在组蛋白去甲基酶（spr-5）功能缺失的线虫中，随着生育能力一代代下降6mA的水平增高。在鉴别出调控6mA的DNA去甲基化酶后，研究人员证实除去组蛋白和DNA去甲基化酶都可以加快跨代生育能力丧失的步伐，表明6mA和组蛋白甲基化有可能协同作用传递了遗传信息。
利用MeDIP-Seq，在野生型线虫中，共检测到766个DNA 6mA的结合峰（peak），并在314个结合峰中检测到AGAAGAAGAAGA基序。

左图为MeDIP-seq的结果展示，右图为SMRT-seq的结果展示

MeDIP-Seq（Methylated DNA Immunoprecipitation Sequencing，甲基化DNA免疫共沉淀测序）是基于抗体富集原理进行全基因组甲基化检测的高通量测序方法，采用甲基化DNA免疫共沉淀技术，通过6-甲基腺嘌呤（anti-6mA）抗体特异性富集基因组上发生甲基化的DNA片段，然后通过高通量测序快速有效地寻找基因组上发生6mA的区域。

原文出处：

Greer EL, Blanco MA, Gu L,等. DNA Methylation on N(6)-Adenine in C. elegans.[J]. Cell, 2015, 161(4).