1.文章简介
| 文章题目 | NAD captureSeq indicates NAD as a bacterial cap for a subset of regulatory RNAs原核生物RNA的NAD帽子结构核生物RNA的NAD帽子结构 |
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| 发表时间 | 2015 |
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| 相关产品 | CAGE-seq |
海德堡大学的Andres Jaschke研究团队于今年在Nature上报道了第一个原核生物中的 RNA 5’端帽子结构。真核生物mRNA中的5’端帽子结构不存在于原核生物中，长期以来人们认为原核mRNA中不存在5’端帽子结构。Andres Jaschke研究团队利用化学-酶捕获和NGS手段（NAD CaptureSeq）发现了细菌RNA中的5’-NAD帽子结构，并证实这种帽子结构同样具有保护RNA分子的功能。
为捕获NAD-RNA，研究者选用了来自海兔属动物Aplysia californica的ADPRC酶（Adenosine diphosphate-ribosylcyclase)。这种酶和可将NAD-RNA分子中的烟酰胺（nicotinamide）基团置换为炔烃醇（alkynyl alcohol），其产物可被生物素标记富集。通过这种NAD captureSeq的方法，该团队的研究者们分析了三个E.coli菌株的NAD-RNA库，发现被高度富集的序列包括某些sRNA和mRNA，但不包含任何rRNA和tRNA。被富集的sRNA和mRNA功能主要集中在前导肽，细胞代谢和胁迫反应等方面，而且大部分由腺嘌呤开始转录。
与其他RNA的5’端修饰的功能相似，细菌RNA的5’端NAD修饰同样可以起到稳定RNA分子，保护其不被RNA酶降解的作用。如体外合成的NAD-RNAI与5’单磷酸RNA和5’三磷酸RNA相比，受到RNaseE攻击时的稳定性分别提高了18.5和3.5倍。在E.coli细胞内，NAD-RNA受到包括NudC介导的去帽途径在内的多种RNA修饰途径的调控。
Jaschke团队的研究者们报道的原核生物RNA的NAD帽子结构显示了RNA修饰调控的复杂性。Jaschke等人表示，原核生物RNA的5’端NAD修饰除了起到稳定RNA的作用外，还可能与特定蛋白结合，影响RNA功能，而进一步搞清NAD-RNA产生机制和功能将是他们接下来的研究重点。
原文出处：
Cahová H, Winz M L, Höfer K, et al. NAD captureSeq indicates NAD as a bacterial cap for a subset of regulatory RNAs.[J]. Nature, 2015, 519(7543).
