miRNA-seq揭示小RNA或成为弥漫性大B细胞淋巴瘤的新的诊断标志物

1.文章简介

2015年麻省理工Technology Review把液体活检列为十大技术突破之一，同年，欧盟批准将循环肿瘤DNA检测用于易瑞沙的伴随诊断，标志着高通量测序技术在临床应用的大突破。近年来随着TCGA（The Cancer Genome Atlas）的癌症遗传数据库不断完善，未来有望开发新的临床诊断标志物。
弥漫性大B细胞淋巴瘤（DLBCL）是成人淋巴瘤中的一种常见恶性肿瘤，其手术后死亡率高达30-40%左右。此前已有零星报道在DLBCL中的microRNA表达与非弥漫性B细胞有差异。2015年Marco A Marra课题组采用miRNA-seq技术对92例DLBCL患者的肿瘤样本进行了检测，同期设置了140例石蜡包埋样本作为校验组，共鉴定出25个与DLBCL相关的microRNA，其中有6个microRNA（miR-28-5p、miR-214-5p、miR-339-3p、miR-5586-5p、miR-324-5p、NOVELM00203M）与患者的生存指数密切相关。通过与TCGA数据库中其他类型癌症的miRNA-seq数据比较，可以看到DLBCL患者中miRNA的表达有其自有的模式。随后课题组下载已发表转录组数据，进行了miRNA与调控靶标的综合分析，如下左图图。结果显示上调miRNA的靶标基因多集中在代谢、细胞周期以及蛋白修饰通路，如下右图。

miRNA-seq的应用之二：外泌体中靶向PTEN的microRNA会介导PTEN的下调，从而诱发脑部转移肿瘤细胞的增殖
对于肿瘤转移灶的细胞增殖，大家一致公认在这一过程中微环境会影响肿瘤细胞的增殖，但是在此过程中机体通过何种方式建立微环境与肿瘤细胞之间的联系还是未解之谜。来自安德森肿瘤中心的研究表明脑部星形胶质细胞分泌的外泌体中microRNA会调控肿瘤细胞的生长。研究者分析了几个不同研究组获得的芯片数据，如下图，发现在脑部肿瘤中PTEN基因的表达都下调。在随后的细胞实验和动物实验证实，PTEN的表达下调是由脑部星形细胞分泌的外泌体microRNA介导的。这一研究建立了肿瘤转移和微环境之间的联系，尤其很好的揭示了脑部肿瘤转移的机制。

原文出处：

Zhang L, Zhang S, Yao J, et al. Microenvironment-induced PTEN loss by exosomal microRNA primes brain metastasis outgrowth[J]. Nature, 2015.
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